生殖器疱疹好发于15-45岁性活跃期男女。
生殖器疱疹好发部位为生殖器及会阴部。男性多见于包皮、龟头、冠状沟和阴茎等处。女性多见于大小阴唇、阴阜、阴蒂、子宫等处。少见部位为肛周、腹股沟、股臀部及阴囊。男性同性恋者常见肛门、直肠受累。
生殖器疱疹临床上分为原发性、复发性和亚临床三种类型，临床表现的轻重及复发频率受病毒型别和宿主免疫状态等因素影响。
1.原发性生殖器疱疹
原发性生殖器疱疹即首次感染HSV-2或HSV-1。潜伏期为2-14天，平均3-5天。
皮损为簇集或散在的小水疱，2-4天后破溃形成糜烂或溃疡，后结痂自愈。
自觉疼痛。常伴腹股沟淋巴结肿痛、发热、头痛、乏力等全身症状。病程一般为2-3周。
2.复发性生殖器疱疹
复发性生殖器疱疹指原发性生殖器疱疹皮损消退后1-4月内病情复发，皮损一般于原部位出现。
复发性生殖器疱疹皮损类似于原发性生殖器疱疹，但病情较轻，病程较短，发疹前常有前驱症状(如局部烧灼感、针刺感或感觉异常等)。
病程一般为7-10天。可间隔2-3周或月余复发多次。
男性同性恋者可累及肛门、直肠，表现为局部疼痛、便秘、里急后重、肛周溃疡等，乙状结肠镜检可见直肠下段黏膜充血、出血和溃疡。
3.亚临床型生殖器疱疹
50%的HSV-1感染者和70%-80%的HSV-2感染者缺乏典型临床表现，为亚临床型生殖器疱疹，是生殖器疱疹主要传染源。
亚临床型生殖器疱疹不典型皮损可表现为生殖器部位的微小裂隙、溃疡等，易被忽略。
4.妊娠期生殖器疱疹
可造成胎儿宫内发育迟缓、流产、早产甚至死产，产道分娩也可引起胎儿感染。生殖器疱疹可引起播散性HSV感染、病毒性脑膜炎、盆腔炎等一系列并发症。
在艾滋病流行地区，生殖器疱疹增加了HIV感染的危险性，同时HIV感染也加剧了生殖器疱疹的流行和病情。在宫颈癌的发生中，HSV-2可能起到协同作用。
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