研究结果
01mNGS及其他检测方法病原体检出率对比
NGS+其他方法
检出整体阳性率9.4%；
总体病原
mNGS阳性率90.3%(97/39)，其他方法阳性率39.5%(/39)，P0.05；
细菌
mNGS检出5例(76.6%)，常规以培养为基础的其他方法仅检出95例(8.9%)；
真菌
mNGS检出41例(1.5%),9例(8.8%)为耶氏肺孢子菌，其中只有8例经常规六胺银染色诊断为耶氏肺孢子菌。
0mNGS及其他检测方法病原体检出情况
细菌（5例)
肺炎链球菌14.9%、流感嗜血杆菌10.0%、金黄色葡萄球菌9.1%、肺炎克雷伯氏菌8.%、鹦鹉热衣原体7.3%、嗜肺军团菌6.4%。
真菌(41例)
耶氏肺孢子菌9例，烟曲霉4例，土曲霉1例。
病毒(例)
由mNGS和PCR方法共检出，鼻病毒(9.4%)、甲型流感病毒(6.4%)、巨细胞病毒(5.8%)和腺病毒(5.5%)。00.1,mNGS检出例新型冠状病毒。
罕见病原体
仅mNGS在同1个患者中检出羌虫病东方体和诺卡氏菌
03免疫功能正常与免疫功能低下患者的病原谱差异
免疫功能正常患者最常见病原体
肺炎链球菌(14.8%)、鼻病毒(9.8%),、流感嗜血杆菌(9.1%),、金黄色葡萄球菌(8.7%),、鹦鹉热衣原体(8.0%)和嗜肺军团菌(7.%)
免疫功能低下患者最常见病原体
耶氏肺孢子菌(44.6%).肺炎克雷伯菌(18.5%)、肺炎链球菌(15.4%)、流感嗜血杆菌(13.8%)和铜绿假单胞菌(13.8%)
临床疑似病原体
念珠菌(43.1%)、疱疹病毒(36.9%)、单纯疱疹病毒1型(1.5%)
04免疫功能正常与免疫功能低下患者感染模式
免疫功能正常患者
单一细菌、细菌细菌、细菌病毒
免疫功能低下患者
单一真菌、细菌真菌、细菌真菌病毒
05SCAP中各种病原微生物共病原检出情况
细菌、真菌和病毒中，分别有73.0%(/)、56.8%(38/67)和85.%(/16)为共同病原体；
呼吸道合胞病毒、肠病毒、副流感病毒、EBV、CMV、HSV1、TTV易与其它病原体混合感染；
肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌、鹦鹉热衣原体，耶氏肺孢子菌等主要与其他病原体混合感染,也可单一致病
06mNGS检测结果对抗生素治疗的影响
（39名患者中，根据mNGS检测结果而调整抗生素的数量和抗菌谱）
降阶梯
5.9%(/39)
升阶梯
6.1%(86/39)主要是针对检测出的特定病原体而增加抗生素，如腺病毒增加更昔洛韦，耶氏肺孢子菌增加卡泊芬净
无变化
1.0%(69/39)
总结
本研究是迄今为止最大的，关于mNGS检测成人SCAP病原学的前瞻性研究；
使用BALF进行mNGS检测，成人SACP的微生物检出率较高，并可检出新发、罕见及少见病原体（新冠、恙虫病东方体、鹦鹉热衣原体、诺卡菌等）；
在免疫功能正常和免疫功能低下的患者中，mNGS均可检出混合感染（56.8%超过种以上病原体，免疫功能低下患者获益更多）；
mNGS是早期识别SCAP潜在病原体，协助临床精准治疗的有力工具：可指导调整治疗方案（5.9%降阶梯，6.1%升阶梯）。
参考文献
WuX,LiY,ZhangM,etal.EtiologyofSevereCommunity-AcquiredPneumoniainAdultsBasedonMetagenomicNext-GenerationSequencing:AProspectiveMulticenterStudy.InfectDisTher.00;9(4):-.
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